公积金月供每月由系统自动从还贷银行卡内扣除，如果办理了公积金余额冲抵还款的话，系统会自动扣除公积金余额还款，如果未办理的话，则会扣除还贷银行卡账户余额还款。
公积金贷款还款方式分为等额本息还款法和等额本金还款法两种，借款人在申请贷款时可以任选其一，选定还款方式后，合同期内不得变更。
等额本息还款法：即借款人每月以相等的金额偿还贷款本息。
等额本金还款法：即借款人每月等额偿还本金加当期应还利息，贷款利息逐月减少，本息合计逐月递减。
注：在贷款期内，符合规定条件，可以申请提前部分还款或一次性提前结清贷款。
1、月冲。这种方式是可以让大家按月将公积金账户上的资金从银行取出来还房贷，也就是说每月存入账户的住房公积金可以用来还每月的贷款，如果出现不足的时候再补齐余额就可以。
2、年冲。年冲是指大家可以以年为单位，一次性将公积金账户中的余额用来冲抵公积金贷款，并且实现了部分提前还款。但购房者在办理组合贷情况下，借款人需要先用公积金账户余额归还公积金贷款本金后，才可以归还另一部分的商贷。
1、如果借款人在办理公积金贷款的时候，在后期的还款过程中，发现自己的公积金余额较多的话。可以考虑使用一次性还款，让公积金帐户的资金冲抵贷款的本金，这样可以减少贷款的利息支出。
2、如果借款人公积金账户中的余额较少的话，在后期还款的过程中，最好不要采用提前还款的方式。因为公积金贷款的过程中，由于优惠的利率，可以帮助借款人省下一大部分利息的支出。因此，这样提前还款的话，公积金账户冲抵的还款金额较少，而自己需要支出的本金较多，是非常不划算的。