法律分析:
违法,化工厂不是行政法上的行政主体,不享有处罚权,无权进行罚款。属于变相的克扣工资,也是违法劳动合同法的,员工可申请劳动仲裁。
法律依据:
《中华人民共和国行政处罚法》 第二十三条 行政处罚由县级以上地方人民政府具有行政处罚权的行政机关管辖。法律、行政法规另有规定的,从其规定。