清晖园布局是大园包小园。现清晖园的三大块大体为：由原正门进入的东南角区，中部的旧园区，西北部近年兴建的新园区。区域间虽有分隔，但却以游廊、甬道以及别出心裁的各式小门相互勾连，融为一体。以旧园区为例，其西部以方池为中心;中部偏北的船厅等是该区的精华所在;南部的竹苑、小蓬瀛、笔生花馆等组成庭院，形成园中有园，即大园包小园的格局和韵味，委婉多姿，让人觉得游之不足。
清晖园没有着力营造假山，其为山之道，即在于远借。这主要归于相地，得地利之便。因三面环山，只要稍筑台阁，即可登高借远处山麓。以凤台为例，远处为凤山，凤山山麓绵延而来，经凤台接引而入园，而园内林木森郁，与远处山麓之青黛一脉相承。如此清晖园与凤山看上去融为一体，园内实无山胜有山也。清晖园北端地势较低，傍池筑船厅，于船厅登高，东可远望太平、神步，西见梯云山也借景之妙法。山势远来，直引至园内池塘，则此池塘仿如远方山麓脚下的山塘，与山景浑然一体。
清晖园内水木清华，幽深清空，景致清雅优美，龙家故宅与扩建新景融为一体，利用碧水、绿树、吉墙、漏窗、石山、小桥、曲廊等与亭台楼阁交互融合，造型构筑别具匠心，花卉果木葱笼满目，艺术精品俯仰即拾，集古代建筑、园林、雕刻、诗画、灰雕等艺术于一体，突显出中国古典园林庭院建筑中“雄、奇、险、幽、秀、旷”的特点。布局形成前疏后密，前低后高的独特布局，但疏而不空，密而不塞，建筑造型轻巧灵活，开敞通透。其园林空间组合是通过各种小空间来衬托突出庭院中的水庭大空间，造园的重点围绕着水亭作文章。
主要景点
清晖园主要景点有船厅、碧溪草堂、澄漪亭、六角亭、惜阴书屋、竹苑、斗洞、狮山、八角池、笔生花馆、归寄庐、小蓬瀛、红蕖书屋、凤来峰、读云轩、沐英涧、留芬阁等，造型构筑各具情态，灵巧雅致，建筑物之雕镂绘饰，多以岭南佳木花鸟为题材，古今名人题写之楹联匾额比比皆是，大部分门窗玻璃为清代从欧洲进口经蚀刻加工的套色玻璃制品，古朴精美，品味无穷。
在花木配置方面，园内花卉果木逾百种，除了岭南园林常用的果树，还栽种了苏杭园林特有的紫竹、枸骨、紫藤、五针松、金钱松、七瓜枫、羽毛枫等，并从山东等地刻意搜集了龙顺枣、龙瓜槐等北京树种，品种丰富，多姿多彩，其中银杏、沙柳、紫藤、龙眼、水松等古木树龄已有百年有余，一年四季，葱茏满目，与古色古香之楼阁亭榭交相掩映，徜徉其间，步移景换，令人流连忘返。
进门为竹苑，穿过右边假山，便是“归寄庐”。清晖园的主体建筑是船厅，它是仿照珠江画舫“紫洞艇”建筑的两层楼舫。船厅前有两口池塘，似将楼船浮在水中，船尾有丫环楼，船头栽有一株沙柳，柳边有一紫藤，犹如一条缆绳。每逢阳春三月，绽出朵朵紫蓝色小花，香气袭人。船厅后边，还有一株白木棉树，以其花淡黄近白而称奇，因为木棉树一般开红花。另有一棵百年银杏，单株结果，也很奇特。